6月3日，学生工作部下发通知，要求在本（专）科学生党员中开展“两学一做”学习教育，《通知》中还明确了具体学习方案。
《通知》指出，全体本（专）科学生党员要严格按照《吉林大学“两学一做”学习安排具体方案》的要求，把学习党章党规与学习习近平总书记系列重要讲话统一起来，在学系列讲话中加深对党章党规的理解，在学党章党规中深刻领悟系列讲话的基本精神和实践要求；各支部要充分认识开展此项活动的重要性、必要性。把党章学习好、遵守好、贯彻好、维护好，确保始终沿着正确的方向前进，凝聚全体支部党员同志的意志和力量，是广大学生党员在推动各项党建工作发展中充分发挥先锋模范作用；各支部的党支部书记以及支部委员要在学习教育中做出表率，紧密联系工作实际，自觉遵守党章、严格依照党章规范言行；切实贯彻党章，增强凝聚力和战斗力；坚决维护党章，防止和纠正违反党章的行为。
《通知》还以时间为线对“两学一做”学习教育工作做出了具体安排。
截至6月，网络学习。要求各单位结合学生工作部组织开展的全国大学生党员“两学一做”专题网络培训示范班学习教育活动，调动全体学生党员学习积极性，教育引导广大学生党员进一步坚定理想信念，提高党性觉悟，进一步增强政治意识、大局意识、核心意识，深刻领会“五位一体”总体布局、“四个全面”战略布局和五大发展理念的内涵，以实际行动做合格党员。
截至12月，个人自学。要求全体学生党员要读原著、学原文、悟原理，带着信念学、带着感情学、带着使命学、带着问题学。各支部要因地制宜，结合本学院的学习工作实际，引导和鼓励全体学生党员学思践悟，撰写学习体会。
截至11月，集中学习讨论。全体支部要制定2016年学生党员集中学习计划，带动全体学生党员自觉主动抓好专题集中学习。各支部每学期要召开2次全体党员会议开展专题学习讨论。每次学习讨论围绕1个专题组织开展。学习讨论可分4个专题进行。
“讲政治、有信念”专题（截至6月中旬），重点结合学习《中国共产党章程》和习近平总书记关于坚持中国特色社会主义“三个自信”、实现中华民族伟大复兴的中国梦等有关重要讲话精神进行学习讨论。
“讲规矩、有纪律”专题（截至6月底），重点结合学习《关于党内政治生活的若干准则》《中国共产党纪律处分条例》《习近平关于党风廉政建设和反腐败斗争论述摘编》《习近平关于严明党的纪律和规矩论述摘编》以及有关警示教育典型案例进行学习讨论。
“讲道德、有品行”专题（截至9月底），重点结合《中国共产党廉洁自律准则》、习近平关于社会主义核心价值观和“好干部”“好教师”的重要论述进行学习讨论。
“讲奉献、有作为”专题（截至11月底），重点结合学习党中央提出的“四个全面”战略布局、“五大发展理念”、习近平总书记关于教育工作的重要论述和学校“十三五”改革与发展规划等进行学习讨论。
各学院各党支部要结合自身学院学生学习工作的情况，进一步细化学习讨论题目，既紧扣主题、又贴近实际，让党员学得进去、议得起来。
《通知》要求，创新方式讲党课（截至至12月底），各支部要结合专题集中学习安排党课内容，每学期至少安排2次党课。鼓励和提倡创新党课形式，通过专题报告、座谈交流、微信互动等灵活方式进行党课学习。
《通知》要求，加强学习型、服务型、创新型党支部建设，践行合格党员（截至12月底）。